Anna Thommen besuchte nach ihrer Ausbildung und ersten Berufserfahrungen als Primarlehrerin den Vorkurs an der Schule für Gestaltung und schloss 2008 den Bachelor «Video» an der HSLU mit dem Film Second me ab. 2013 folgte der Master in Filmregie an der ZHdK mit dem Dokumentarfilm Neuland, welcher zahlreiche Festivalpreise unter anderem 2013 das «Goldene Auge» des ZFF gewann. 2019 erschien ihr neuer Film Volunteer in Zusammenarbeit mit Lorenz Nufer, der auch den Basler Film- und Medienkunstpreis gewann.